قدم الصندوق مساعدات عينية ومالية للدول الأعضاء بمنظمة التعاون الإسلامي، والأقليات المسلمة التي حلت بها الكوارث الطبيعية والأزمات في 60 دولة، وذلك للتخفيف من آثارها فعلى سبيل المثال لا الحصر قدم الصندوق العون إلى كل من فلسطين ، واليمن، وكشمير، وافغانستان،  ودول جنوب الصحراء الكبرى في أفريقيا، والبوسنة والهرسك، وكوسوفو، ولدول جنوب شرق آسيا التي تضررت من كارثة المد البحري (تسونامي) واللاجئين الروهنجين في ماليزيا وبنجلاديش، والتخفيف من معاناة المتضررين من آثار السيول والفيضانات التي اجتاحت بعض الولايات بجمهورية السودان،  فضلاً عن تقديم مساعدة للتخفيف من حادث انفجار مرفأ بيروت بالجمهورية اللبنانية، وخلال العام 2023م قدم الصندوق مساعدات إنسانية لدولة ليبيا وسوريا وتشاد وتركيا والمغرب، ودعم جهود جمعية الهلال الأحمر الفلسطيني في إنقاذ المصابين الفلسطينيين والتخفيف من آثار العدوان الإسرائيلي على قطاع غزة.